国立北京医学专门学校经各期发展，毕业学生如洪式闾、鲍鉴清、徐佐夏、刘兆霖、高邃、颜守民、毛咸、许世瑾、胡懋濂、杨敷海、陈友浩、梁铎、林振纲、林幾、徐开、余贺、林子扬、杨其昌、王同观、毛鸿志、刘士琇、黄万杰、厉矞华、隋式棠、贾淑荣等数十人先后留校或返校任教，多数再经官费（由学校或原籍省支付）或自费公补等方式被送往德、日等国留学，逐渐成为学校的中坚力量；每年派教师赴国外考察或继续研究，提高学术水平。

1913年11月22日，由校长汤尔和结合中国国情起草的《解剖条例》，被以中央政府内务部令公布，这是中国自己的第一个解剖法令；1928年由徐诵明院长首倡在中国首次用中文进行教学；多人参与审订医学名词，起草相关制度，编辑学术刊物；以汤尔和博士为首，周颂声、吴祥凤、蹇先器、徐诵明、王同观等翻译日本医学专著数十种（周颂声编著《生理学》、葛成勋编著《外科学总论》、吴祥风编著《临床便览》、刘兆霖编著《外科学各论》等），徐佐夏、梁铎、林振纲、周颂声、侯宗濂等发表多篇学术论文。

1923年9月在全国最早实行6年制（两年预科，四年本科），开创了国人所办高等医学教育最长学制。1930年10月，直接从高中毕业生招收6年制本科生，以“研究高深学术、培养医学专门人才”为宗旨。1915年2月15日附设诊所开诊，到1928年11月把诊所迁扩建为北平大学医学院附属医院（京城百姓称之为“平大医院”）。经不断发展，“平大医院”成为一所综合实力仅次于协和医院的教学医院。

经过25年发展，校（院）长先后由汤尔和、葛成勋、周颂声、洪式闾、张黻卿、孙柳溪、徐诵明、吴祥凤担任，师生们克服经费不足、教学设备有限的困难，努力教、学，使得规模不断扩大、质量不断提高。1913年到1925年6月，共培养4年制专门毕业生363名； 1923年9月到1937年6月，共培养6年制本科毕业生259名。国内许多著名的医学教育家和学科奠基人都从其中诞生。其中，贺宗霖（贺诚）成为红色革命家和新中国卫生事业的主要领导者之一。在国人所办医学院校中，学校被认为是“所得经费最少、培养人才最多”“汇集了一大批卓有成就的国内外知名学者，他们代表了当时我国医药卫生各学科的最高水平”，对中国现代医学教育发展影响深远。

1937年7月卢沟桥事变爆发后，平津相继沦陷。国民政府教育部令国立北平大学赴陕组建国立西安临时大学，医学院师生随校西迁，在陕西度过最艰苦的抗战岁月，经各期发展，成为现今的西安交通大学医学部。医学部实为国立北平大学医学院正脉之延续和直接继承者。

作者  杨龙